Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SAMD13Q5VXD3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SAMD13Q5VXD3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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