Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01545Q5VT33 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01545Q5VT33 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms