Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP28Q4G0W2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms