Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q1T7F1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q1T7F1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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