Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GEN1Q17RS7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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