Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PMCHL1Q16048 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PMCHL1Q16048 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PMCHL1Q16048 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PMCHL1Q16048 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PMCHL1Q16048 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PMCHL1Q16048 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMCHL1Q16048 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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