Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1CQ15572 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF1CQ15572 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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