Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKD1Q15139 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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