Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSHL1Q14406 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms