Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CIRBPQ14011 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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