Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TOP3AQ13472 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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