Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNTA1Q13424 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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