Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHAF1BQ13112 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHAF1BQ13112 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms