Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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IFT88Q13099 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT88Q13099 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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