Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NCS1P62166 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NCS1P62166 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCS1P62166 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCS1P62166 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCS1P62166 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCS1P62166 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCS1P62166 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCS1P62166 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCS1P62166 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCS1P62166 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCS1P62166 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms