Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ABCE1P61221 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ABCE1P61221 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms