Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GBP2P32456 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms