Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSSP25774 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms