Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGS1P23219 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGS1P23219 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms