Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms