Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF35P13682 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms