Protein–RNA interactions for Protein: P03901

MT-ND4L, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND4LP03901 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MT-ND4LP03901 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms