Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD3O95983 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD3O95983 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD3O95983 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD3O95983 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD3O95983 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms