Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTL6BO94805 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms