Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
JRKO75564 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
JRKO75564 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
JRKO75564 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
JRKO75564 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JRKO75564 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JRKO75564 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms