Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH6O60337 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms