Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSH5O43196 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MSH5O43196 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSH5O43196 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MSH5O43196 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TBCA-202ENST00000380377 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MSH5O43196 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MSH5O43196 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSH5O43196 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSH5O43196 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSH5O43196 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms