Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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