Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CELF2-AS2-202ENST00000432370 1227 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEDD1Q8NHV4 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms