Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CACNA1C-202ENST00000335762 6968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MTAP-201ENST00000380172 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 COL25A1-208ENST00000610288 4799 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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