Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00312Q9Y6C7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms