Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLDN16Q9Y5I7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms