Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HIGD1AQ9Y241 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIGD1AQ9Y241 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms