Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAK1Q9UPV9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAK1Q9UPV9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms