Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP22Q9UPT9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP22Q9UPT9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms