Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHMP5Q9NZZ3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHMP5Q9NZZ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms