Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCLQ9NW38 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCLQ9NW38 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms