Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPHNQ9NQX3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPHNQ9NQX3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms