Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms