Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPAP3Q9H6T3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms