Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA6AQ9H2E6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms