Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms