Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms