Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCG3Q8WXD2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG3Q8WXD2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms