Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF554Q86TJ5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF554Q86TJ5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms