Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ZBED9Q6R2W3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZBED9Q6R2W3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms