Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUPD1Q68J44 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms