Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CHIC1Q5VXU3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CHIC1Q5VXU3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC1Q5VXU3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms