Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PXDC1Q5TGL8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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