Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATAD3CQ5T2N8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms